정부는 25일 하오 이홍구 국무총리 주재로 홍수대책 마련을 위한 긴급 관계장관회의를 열고 일단 1차로 태풍 재니스호가 우리나라를 완전히 빠져나갈 것으로 예상되는 26일 하오 5시까지 군인과 경찰을 포함한 전 공무원에게 비상근무체제에 들어가도록 했다.

또 시장·군수 책임 아래 각 수계의 저지대 주민들을 안전지대로 대피시키고,산사태가 우려되거나 축대등이 무너질 가능성이 있는 위험지역을 24시간 예방순찰하는등 인명 피해를 최소화하는데 역점을 두기로 했다.

이와 함께 각급 학교는 학교장 재량으로 휴교할 수 있도록 하고,행정기관은 물론 민간기업도 직원들의 출퇴근시간을 조정하도록 협조를 요청하기로 했다.