이대동대문병원은 최근 한국희귀난치성질환연합회와 진료협력병원 협약식을 가졌다. 이에 따라 이 병원은 연합회가 추천하는 환자에 대해 일정액의 의료비를 지원하고 후원자를 연결해 많은 환자들에게 질병 치료기회를 줄 것으로 기대된다. 한국희귀난치성질환연합회는 50여개의 환우회 및 협회를 가진 단체이다.